生物介紹
非細(xì)胞型微生物包括病毒和噬菌體。這是一些沒有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的微生物。它們具有一個核酸芯子和一個蛋白質(zhì)外殼,不能獨立生活,只能在其它生物的細(xì)胞內(nèi)生長繁殖。但是它們具有生物的基本特性,即能進(jìn)行自我復(fù)制并將其性狀遺傳至下一代。寄生在動物與植物細(xì)胞內(nèi)的這類生物稱之為病毒:寄生在細(xì)菌細(xì)胞中的這類微生物稱之為噬菌體(亦稱細(xì)菌病毒)。
病毒是1892年由伊凡諾夫斯基在研究煙草花葉病時發(fā)現(xiàn)的。但是直到1935年Stanley才將煙草花葉病的病毒正式確定。
這種微生物僅有一種核酸類型,即由DNA或RNA構(gòu)成核心,外披蛋白質(zhì)衣殼,有的甚至僅有一種核酸不含蛋白質(zhì),或僅含蛋白質(zhì)而沒有核酸。如病毒(virus)、亞病毒(subvirus)、朊粒(prion)。
非細(xì)胞型微生物包括病毒和亞病毒,后者又包括類病毒、擬病毒和朊病毒。
主要類群
已發(fā)現(xiàn)并命名的非細(xì)胞型微生物約有3600種,國際病毒分類委員會(internationalcommittee on taxonomy of virus,ICTV)根據(jù)病毒核酸類型、顆粒大小、形態(tài)、衣殼對稱性,殼微粒數(shù)目及排列、有無包膜等對病毒采用一種非系統(tǒng)的、多原則的、分等級的分類法。2001年ICTV公布的病毒分類命名第七次報告中將病毒分為66個科、9個亞科和244個屬。其中與人類關(guān)系較為密切的病毒有19科50多個屬。
除了典型的病毒外,還有一些病毒樣致病因子,其本質(zhì)及在病毒學(xué)中的位置尚不明確,被稱為亞病毒(subvirus)。包括:
- 類病毒(viroid),1971年由Diener在研究馬鈴薯紡錘形塊莖病時發(fā)現(xiàn)的一種比典型病毒更簡單的感染因子,沒有蛋白質(zhì)衣殼,只有裸露的單股共價閉合環(huán)狀RNA分子,主要使植物致病,與人類疾病關(guān)系尚不明了。
- 衛(wèi)星病毒(satel—lites),衛(wèi)星病毒可分為兩大類,一類可編碼自身的衣殼蛋白,另一類為衛(wèi)星病毒RNA分子,曾稱為擬病毒(virosid),需利用輔助病毒的蛋白衣殼。其特點為由500---2000個核苷酸構(gòu)成的單鏈RNA,與缺陷病毒不同,表現(xiàn)為與輔助病毒基因組間無同源性;復(fù)制時常干擾輔助病毒的增殖。
- 朊病毒(prion),Prusiner等認(rèn)為它是一種傳染性蛋白顆粒,不含或僅含極微量的核酸,是引起羊瘙癢病、瘋牛病和人類克一雅綜合征(ereutfeldt—Jokob dis—ease,C—JD)的病原體?。
生物學(xué)特點
非細(xì)胞的大分子—分子生物;細(xì)胞內(nèi)的生物態(tài)和細(xì)胞外的非生物態(tài)—“生活周期”;只含一種甚至沒有核酸。
病毒
1898年
荷蘭人貝哲林克(Beijerinck)認(rèn)為煙草花葉病的感染因子是比細(xì)菌小的有傳染性的活的液體,并起名為病毒(virus)。
病毒的概念
:是一類由核酸和蛋白質(zhì)等少數(shù)幾種成分組成的超顯微“非細(xì)胞生物”,其本質(zhì)是一種只含DNA或RNA的遺傳因子,能以感染態(tài)和非感染態(tài)兩種狀態(tài)存在。即在宿主體內(nèi)呈感染態(tài)(活細(xì)胞內(nèi)專性寄生),依賴宿主的代謝系統(tǒng)獲取能量、合成蛋白質(zhì)和復(fù)制核酸,再通過核酸與蛋白質(zhì)的裝配而實現(xiàn)其大量繁殖;在離體條件下,能以無生命的生物大分子長期存在,并可保持其侵染活性。
病毒是一類超顯微的非細(xì)胞型生物,每一種病毒只含有一種核酸;它們只能在活細(xì)胞內(nèi)營專性寄生,靠其宿主代謝系統(tǒng)的協(xié)助來復(fù)制核酸、合成蛋白質(zhì)等組分,然后再進(jìn)行裝配而得以增殖;在離體條件下,它們能以無生命的化學(xué)大分子狀態(tài)長期存在并保持其侵染活性。病毒分布極為廣泛,幾乎可以感染所有的生物,包括各類微生物、植物、昆蟲、魚類、禽類、哺乳動物和人類。
一形態(tài)構(gòu)造和化學(xué)成分
成熟的,結(jié)構(gòu)完整的,具有感染性的單個病毒稱作
病毒粒
或 病毒體
(virion),也稱 病毒粒子
或 病毒顆粒
(virus particle)。(一)大小和形態(tài)
病毒的形體極微小,直徑一般為100nm上下(20~200 nm)(1 nm = 0.001μm),最大的痘苗病毒約300nm,脊髓灰質(zhì)炎病毒僅28nm,能通過細(xì)菌濾器,必須借助電子顯微鏡才能觀察。
粗略認(rèn)為病毒、細(xì)菌和真菌這三類微生物個體直徑比約為1:10:100。病毒的形態(tài)有磚形(如牛痘病毒)、桿狀(如煙草花葉病毒)、球狀(如流感病毒)、蝌蚪形和絲狀(如某些噬菌體)等。
(二)病毒的化學(xué)組成與結(jié)構(gòu)
病毒由蛋白質(zhì)與核酸組成,且每一病毒只含有RNA或DNA一種核酸。少數(shù)幾種較大的病毒還含有脂肪、多糖等(組成包膜)。病毒核酸是病毒繁殖、遺傳變異與感染性的物質(zhì)基礎(chǔ),蛋白質(zhì)主要作用是:構(gòu)成病毒的外殼(衣殼),保護(hù)病毒核酸;決定病毒感染的特異性;決定病原的抗原性,并刺激機(jī)體產(chǎn)生相應(yīng)抗體;構(gòu)成病毒組成中的酶(但一般病毒是不具酶或酶系極不完全的)。
1核酸
核酸
組成各種病毒的核心。一種病毒只含有一種類型的核酸,DNA或RNA。核酸可以是單股的,可能是雙股的;可以是線狀的,也可以是環(huán)狀的。大多數(shù)病毒粒子中只含有一個核酸分子。少數(shù) RNA 病毒含 2 個或 2 個以上的核酸分子,它們一起構(gòu)成病毒的基因組,如流感病毒。病毒核酸 ( 基因組 ) 儲存著病毒的遺傳信息,控制著其遺傳變異、增殖和對宿主的感染性等。病毒核酸類型多樣,是病毒系統(tǒng)分類中最可靠的分子基礎(chǔ)。
2殼體
(caspsid)即
衣殼
,是指圍繞病毒核酸并與之緊密相連的蛋白質(zhì)外殼,它由許多衣殼粒 ( capsomere
) 組成。衣殼粒
是指在電子顯微鏡下可以辨認(rèn)的組成殼體的形態(tài)學(xué)亞單位,由一個或多個多肽分子組成。殼體的作用是構(gòu)成病毒粒子主要支架結(jié)構(gòu)和抗原成分,保護(hù)病毒核酸,決定病毒感染的特異性等。
3包膜
(envelope)也稱 囊膜。指包被在病毒核殼體外的一層含蛋白質(zhì)或糖蛋白的脂質(zhì)雙層膜。囊膜表面往往具有突起物,稱
刺突
(spike)。囊膜的有無及其性質(zhì)與該病毒的宿主專一性和侵入等功能有關(guān)。(三)病毒的對稱體制及其典型代表
根據(jù)衣殼粒排列方式的不同將病毒分為三種對稱類型:
1螺旋對稱
衣殼粒沿著螺旋形的核酸鏈對稱排列,
TMV (tabacoo mosaic virus)
是其代表。TMV外形呈直桿狀,長300nm,寬15nm,中空(內(nèi)徑4nm)。由95%的衣殼蛋白和5%的ssRNA組成。衣殼含有2130個皮鞋狀的蛋白亞基——衣殼粒。衣殼粒以逆時針方向繞核酸作螺旋狀排列,共圍130圈。ssRNA由6390個核苷酸構(gòu)成,以等螺距排列于蛋白質(zhì)衣殼內(nèi),每3個核苷酸與1個衣殼粒結(jié)合。
2 20面體對稱
核酸濃集成球形或近似球形,外周的衣殼粒排列成20面體對稱。
腺病毒
(adenovirus)是其代表。腺病毒外形呈“球狀”,實為一典型的20面體,直徑70~80nm,具有12個角,20個面和30條棱。核心由36500bp的線狀dsDNA構(gòu)成。
3復(fù)合對稱
病毒結(jié)構(gòu)較復(fù)雜,既有螺旋對稱又有20面體對稱。E.coliT 偶數(shù)噬菌體(T2、T4、T6)是其代表。
(四)病毒的繁殖
病毒增殖所需原料、能量和生物合成的場所均由宿主細(xì)胞提供,在病毒核酸的控制下合成病毒的核酸(RNA或DNA)與蛋白質(zhì)等成分,然后在宿主細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核內(nèi)裝配成為病毒粒子(系指成熟的或結(jié)構(gòu)完整、有感染性的病毒個體,與病毒是同義詞),再以各種方式釋放到細(xì)胞外,感染其他細(xì)胞。這種增殖方式稱為復(fù)制。
病毒的繁殖過程可分為五個連續(xù)步驟:
1.吸附 具高度專一性地吸附于敏感細(xì)胞表面的接受部位。
2.侵入 以各種方式(取決于宿主細(xì)胞的性質(zhì))侵入敏感細(xì)胞內(nèi)。
3.脫殼 脫去衣殼和包膜,方式因種而異。
4.生物合成 包括核酸的復(fù)制和蛋白質(zhì)的合成等。
5.裝配 分別合成的核酸和蛋白質(zhì)組合成完整的、新的病毒粒子。病 毒感染細(xì)胞后,常可使宿主細(xì)胞形成一種在光學(xué)顯微鏡下可見的小體,謂包涵體。
(五)病毒的群體形態(tài)
1包涵體
(inclusion body)是指在某些感染病毒的宿主細(xì)胞中,出現(xiàn)光鏡下可見的大小、形態(tài)和數(shù)量不等的小體。根據(jù)包涵體特點,將其分為4類:病毒的聚集體;病毒的合成部位;病毒蛋白及病毒感染有關(guān)的蛋白;非病毒性包涵體。
包涵體在實踐上的應(yīng)用
:①病毒病的輔助診斷;②昆蟲生物防治。2噬菌斑
(plaque)將少量噬菌體和大量敏感細(xì)菌與瓊脂培養(yǎng)基在平皿中混勻,適溫下培養(yǎng)數(shù)小時后,會在長滿細(xì)菌的菌苔上出現(xiàn)一個個肉眼可見的有一定形狀、大小、邊緣和透明度的斑點,即噬菌斑。
噬菌體
噬菌體(bacteriophage, phage) ,即原核生物的病毒,包括噬細(xì)菌體(bacteriophage) 、噬放線菌體和噬藍(lán)細(xì)菌體等。它們廣泛分布于自然界,凡有原核生物活動之處,幾乎都有其相應(yīng)的噬菌體存在。
(一)噬菌體的形態(tài)
噬菌體構(gòu)造
噬菌體
由頭部、頸部和尾部三部分構(gòu)成,呈蝌蚪狀。頭部
呈橢圓形20面 體對稱,長95nm,寬65nm,由212個衣殼粒組成,衣殼內(nèi)有線狀dsDNA核心,由175000bp構(gòu)成。頭相聯(lián)處有一簡單的 頸部
,包括 頸環(huán)
和 頸須
。尾部
呈螺旋對稱,由 尾鞘
、尾管
、基板
、刺突
和 尾絲
組成。噬菌體是侵染細(xì)菌、放線菌和真菌等細(xì)胞型微生物的病毒。(二)噬菌體的繁殖
噬菌體的繁殖一般分為五個階段:
吸附
、侵入
、增殖
(復(fù)制和生物合成)、成熟
(裝配
)和 裂解
(釋放
)。凡在短時間內(nèi)能連續(xù)完成這五個階段而實現(xiàn)其增殖的噬菌體,稱 烈性噬菌體(
virulent phage),
反之則稱 溫和噬菌體(temperate phage)。
1吸附
噬菌體侵染寄主細(xì)胞的第一步為吸附。敏感的細(xì)菌細(xì)胞表面具有噬菌體吸附的特異性受體。一種細(xì)菌可以被多種噬菌體感染,這是因為宿主細(xì)胞表面對各種噬菌體有不同的吸附受體。吸附過程也受環(huán)境因子的影響,如 pH 、溫度、離子濃度等都會影響到吸附的速度。2侵入
即注入核酸。3增殖
包括核酸的復(fù)制和蛋白質(zhì)的合成。4成熟
或 裝配
5裂解
或 釋放
裂解量(burst size):
平均每一宿主細(xì)胞裂解后所產(chǎn)生的子代噬菌體數(shù)量。自外裂解
:
由于大量噬菌體吸附于同一宿主細(xì)胞表面并釋放大量溶菌酶而從外部裂解細(xì)胞,不產(chǎn)生子代噬菌體的裂解。1.烈性噬菌體和溫和噬菌體 根據(jù)噬菌體與宿主細(xì)胞的關(guān)系,可分為烈(毒)性噬菌體和溫和噬菌體兩類。
烈性噬菌體感染宿主細(xì)胞并進(jìn)行復(fù)制,產(chǎn)生更多的病毒粒子,宿主細(xì)胞裂解,釋出新的子代噬菌體。在適宜條件下,此過程可重復(fù)進(jìn)行。烈性噬菌體的這種生長(繁殖)方式謂一步生長。以培養(yǎng)時間為橫坐標(biāo),以噬菌班數(shù)為縱坐標(biāo)作圖,可繪得噬菌體的一步生長曲線(圖示)
溫和噬菌體侵染宿主細(xì)胞后,其核酸整合到宿主的染色體上或附著在宿主細(xì)胞膜的某些位點上,宿主細(xì)胞繼續(xù)進(jìn)行生長繁殖。
2.原噬菌體與溶原性細(xì)菌 整合到宿主染色體或附著在宿主細(xì)胞膜上的溫和噬菌體的核酸稱為原(前)噬菌體。
含有原噬菌體的細(xì)菌稱為溶原性細(xì)菌。溶原性細(xì)菌具有以下基本特性:①遺傳性——子代細(xì)菌也具溶原性;②自發(fā)或誘發(fā)裂解——自發(fā)地或由理化因子導(dǎo)致原噬菌體活化,產(chǎn)生具感染性的噬菌體粒子;③“免疫性”——不受其他同類噬菌體侵染;④復(fù)愈(非溶原化)——原噬菌體消失,變成非溶原細(xì)胞;⑤可獲得一些新的特性,如菌落形態(tài)改變,產(chǎn)生毒性等。
3.烈性噬菌體的培養(yǎng)特征 烈性噬菌體在混有大量活敏感菌的瓊脂培養(yǎng)基中,經(jīng)培養(yǎng)后,肉眼可見在布滿宿主細(xì)胞的菌苔上,有一個個不長菌的斑塊,此即噬菌斑。噬菌斑的形狀、大小、邊緣和透明度,均因噬菌體不同而異。
(三)噬菌體效價的測定
效價
(titre, titer),表示單位體積試樣中所含的具侵染性的噬菌體粒子數(shù),又稱 噬菌斑形成單位
(plaque-forming unit, pfu
)或 感染中心數(shù)
。常用 雙層平板法測定。(四)一步生長曲線
噬菌體生長曲線
定量描述烈性噬菌體生長規(guī)律的實驗曲線,稱 一步生長曲線
或 一級
生長曲線(one step growth curve)
。它可反應(yīng)每種噬菌體的3個重要特征參數(shù)—— 潛伏期(latent
phase)、裂解期(rise phase)
和 裂解量(burst size)。
1潛伏期
指噬菌體的核酸侵入宿主細(xì)胞后至第一個成熟噬菌體粒子
釋放
前的一段時間。潛伏期又可分為兩段:
隱晦期
,指在潛伏期前期人為的用氯仿等裂解宿主細(xì)胞后,此裂解液仍無侵染性的一段時間;胞內(nèi)累積期
,指即潛伏后期,在隱晦期后,人為地裂解細(xì)胞后,其裂解液已呈現(xiàn)侵染性的一段時間。2裂解期
在潛伏期后的宿主細(xì)胞迅速裂解、溶液中噬菌體粒子數(shù)急劇增多的一段時間。
3平穩(wěn)期
感染后的宿主細(xì)胞已全部裂解,溶液中噬菌體效價達(dá)到最高點的時期。
4裂解量
平均裂解量= 平穩(wěn)期plaque數(shù) / 潛伏期plaque數(shù)
(五)
溶源性溶源性(lysogeny)
溫和噬菌體
侵入宿主細(xì)胞后產(chǎn)生的一種特性,又稱 溶源現(xiàn)象
。1溫和噬菌體
(temperate phage)凡吸附并侵入宿主細(xì)胞后,噬菌體的基因組只整合到宿主的基因組上,并可長期隨宿主基因組的復(fù)制而進(jìn)行同步復(fù)制,一般情況下并不引起宿主細(xì)胞裂解的噬菌體稱溫和噬菌體或溶源噬菌體
(lysogenic phage)。
溫和噬菌體的特點
:①dsDNA;②具有整合的能力——處于整合態(tài)的噬菌體稱 前
或 原噬菌體(
prophage)
;③ 同步復(fù)制能力。溫和噬菌體的存在形式
:① 游離態(tài);②整合態(tài);③營養(yǎng)態(tài)。2溶源菌(lysogen or lysogenic bacteria)
指在基因組上整合有前噬菌體并能正常復(fù)制而不被裂解的細(xì)菌,如E.coliK12(λ)。
溫和噬菌體感染細(xì)菌使之成為溶源菌的過程,稱
溶源化(lysogenization)。
溶源菌的特性
:① 自發(fā)裂解;② 誘導(dǎo),又稱誘發(fā)裂解;③ 免疫性,又稱超感染免疫性等;④ 復(fù)愈,又稱非溶源化;⑤ 溶源轉(zhuǎn)變。亞病毒
亞病毒(subvirus)是一類比病毒更為簡單的非細(xì)胞型生物,僅由核酸或蛋白質(zhì)一種成分構(gòu)成的分子病原體,主要包括類病毒、擬病毒和朊病毒三類。
(一)類病毒(viroid)
類病毒是一種具有傳染性的單鏈RNA病原體。它比病毒要小,且沒有典型病毒所有的蛋白質(zhì)外殼。類病毒為嚴(yán)格寄生物,專一性很強(qiáng),通常感染高等植物,并整合到植物的細(xì)胞核內(nèi)進(jìn)行復(fù)制。類病毒通常通過種子或花粉傳播。類病毒最早由在美國工作的瑞士學(xué)者迪納(Theodor O. Diener)于1971年在馬鈴薯紡錘塊莖病中發(fā)現(xiàn)。
類病毒象病毒一樣,嚴(yán)格專性寄生,只在宿主細(xì)胞內(nèi)才表現(xiàn)出生命特征——核酸分子的自我復(fù)制,使宿主致病,死亡。但類病毒比病毒更小,更簡單。類病毒僅是能感染某些植物致病的單鏈閉合環(huán)狀的RNA分子、無蛋白質(zhì)外殼的游離的RNA分子,分子量約5×104Da~10×104Da。類病毒對各種化學(xué)和物理因子的作用都不敏感,對熱以及紫外光和離子輻射有高度抗性。到目前為止,類病毒只在植物中被發(fā)現(xiàn)。
(二)擬病毒(virusoid)
擬病毒(virusoid),又稱類類病毒(viroid-like),殼內(nèi)類病毒,衛(wèi)星RNA (satellite RNA),指一些必須依賴輔助病毒進(jìn)行復(fù)制的小分子單鏈RNA片段,即包裹在真病毒中的有缺陷的類病毒,可認(rèn)為是一類包裹在植物病毒粒子中的類病毒。
輔助病毒(helper virus):被擬病毒寄生的真病毒。
擬病毒在核苷酸組成、大小和二級結(jié)構(gòu)上均與類病毒相似;
擬病毒的特點:
①單獨沒有侵染性,必需依賴于輔助病毒才能進(jìn)行侵染和復(fù)制,其復(fù)制需要輔助病毒的RNA聚合酶。
②RNA不具有編碼能力,需要利用輔助病毒的外殼蛋白,并與輔助病毒基因組RNA一起包裹在同一病毒粒子內(nèi)。
③可干擾輔助病毒的復(fù)制。
④擬病毒同輔助病毒基因組RNA比較,沒有序列同源性。
(三)朊病毒
朊病毒又稱蛋白質(zhì)侵染因子。據(jù)目前所知,朊病毒是一類能侵染動物并在宿主細(xì)胞內(nèi)復(fù)制的小分子無免疫性的疏水蛋白質(zhì),分子量2.7×104Da~3×104Da。在電鏡下,朊病毒呈桿狀顆粒,成叢排列,每叢大小和形狀不一。
1982年美國學(xué)者Prusiner在研究羊瘙癢?。╯crapie in sheep)時最先發(fā)現(xiàn)朊病毒。并因此獲得1997年的諾貝爾生理和醫(yī)學(xué)獎獎。
朊病毒或朊粒,又稱蛋白侵染因子(protein infection),是一類不含核酸的傳染性蛋白質(zhì)分子。能引起宿主體內(nèi)正常的同類蛋白質(zhì)分子發(fā)生與其相似的構(gòu)象變化而使宿主發(fā)病。
該病是一種神經(jīng)病學(xué)疾病,??芍卵蛩劳觥F渌恍┘膊?,包括瘋牛病和人的Kuru?。↘uru為新幾內(nèi)亞一地名,最初此病在當(dāng)?shù)厝酥袀魅?,不知病因而以地名稱之),亦是朊病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)繁殖的結(jié)果,均以神經(jīng)系統(tǒng)緩慢退化以至發(fā)生紊亂為特征。
從僅由蛋白質(zhì)組成的朊病毒,可以看到生命系統(tǒng)的一個普遍特征(即遺傳信息貯藏在核酸分子中)的一個例外。因而,朊病毒的發(fā)現(xiàn),可能對分子生物學(xué)的發(fā)展產(chǎn)生革命性的影響,還可能為弄清一系列疑難疾病的病因帶來新的希望。
prion病的共同特征是
:潛伏期長(幾個月、幾年甚至幾十年),引起致死性中樞神經(jīng)系統(tǒng)的慢性退化病。
純化的感染因子稱為朊病毒蛋白(Prion protein,PrP),分子量為33~35kDa,約250個氨基酸組成,分子量為27000至35000,僅為最小真病毒的1%。
朊病毒與真病毒的主要區(qū)別
:①無核酸成分;②由宿主基因編碼;③對宿主無免疫原性;④呈淀粉樣顆粒狀;⑤抗逆性強(qiáng)。